Database
A biogeografia de comunidades bacterianas é um tópico-chave na Ecologia Microbiana. Em relação à águas continentais, muitos estudos foram realizados no hemisfério norte, deixando uma lacuna nos padrões de diversidade microbiana em uma escala global. A América do Sul abriga cerca de um terço de toda a água doce do mundo, mas é uma das regiões menos estudadas. Para preenxer esta lacuna, nós compilamos dados de sequenciamento amplicom do gene 16S rRNA de comunidades microbianas abarcando os ecossistemas de águas continentais sulamericanos, e apresentamos a primeira base de dados µSudAqua[db]. Esta base de dados contém mais de 872 amostras georreferenciadas de 9 diferentes ecoregiões contendo informações ambientais para cada uma delas. Para sua integração e validação, nós construímos uma base de dados curada (µSudAqua[db.sp]) de amostras sequenciadas na plataforma Illumina MiSeq e os mesmos primers universais para procariotos. Isto compõe cerca de 60% de todas as amostras georreferenciadas contidas na µSudAqua[db]. Esta compilação foi realizada na escopo da rede colaborativa µSudAqua e representa uma das mais completas bases de dados de comunidade microbianas de águas continentais da América do Sul. Veja a documentação para mais detalhes, ou acesse a base de dados.
